没有哪个更好，只有哪个更适合。我先说商标注册和转让的利弊，再说公司哪些实际情况建议注册，哪些建议转让。
1、注册商标：你自己到工商局商标窗口注册，价格300元一件；找代理机构注册价格600元到2000多元不等。可以选择自己喜欢的商标名字、图形，拿到注册证的时间目前在14个月左右，有可能到最后注册不下来，耽误时间。
商标转让：公证价格在300-500元（一般卖方出），转让手续费大约1500左右（代理机构收取的，一般买方出），商标转让费一般在几千元到几十万不等，也有更高的，这种很少。转让过来的商标很短时间就可以用。
2、对初创企业来说，如果你不知道经营什么，只有一个大概范围，或者刚进入一个行业，还不太了解该行业，建议你注册商标。在等待商标证的这段时间可以深入了解一下，做些代理、代销类的业务。
比如你做女装，喜欢哪种风格、针对什么人群，可以在淘宝上做代销，也可以线下做代理，对这个行业有了一定的了解，确定了自己的盈利模式，可以使用自己注册的商标来做，在之前做代理期间也有了一定的客户积累，不打无准备之仗。
如果你已经对某个行业有了一定的了解，不管你是找厂家贴牌，还是自己生产，建议你购买一个商标，这样快，因为市场不等人。
这种情况下，如果你注册新商标也可以，但被驳回的话，那你前期的广告宣传、包装等各种投入会有损失，甚至还可能惹上官司，毕竟商标被驳回，就不一定是你的了，如果继续使用这个商标，可能涉嫌假冒注册商标或侵犯他人的商标权。
你根据自己实际情况来定吧！